Научно-исследовательский институт кардиологии был основан в Санкт-Петербурге в 1980 году. Необходимость его учреждения возникла в 70-е годы в связи с ростом заболеваемости населения от болезней системы кровообращения.
НИИ был образован как институт кардиологии РСФСР. Инициировал его учреждение профессор В. А. Алмазов, заведующий кафедрой факультетской терапии 1-го ЛМИ им. акад. И. П. Павлова. Институту был передан кардиоревматологический диспансер и стационар на 300 коек; поставлены задачи совершенствования и создания новых методов диагностики, лечения и профилактики сердечно-сосудистых заболеваний; создан дистанционный диагностический центр, где специалисты анализировали передаваемые по телефонным линиям связи электрокардиограммы; в поликлиническом отделении получали помощь тысячи граждан.
С целью осуществления научно-клинических исследований в НИИ кардиологии были созданы отделения артериальной гипертензии, ишемической болезни сердца, неотложной кардиологии, организован блок интенсивной терапии. Сразу в первые годы функционирования НИИ, высококвалифицированные врачи и научные сотрудники выполняли сложные фундаментальные и прикладные научно-исследовательские работы; проводились исследования по созданию образцов отечественной медицинской техники.
В 2009 — 2017 г. осуществлялось строительство новых корпусов и реконструкция медицинского комплекса; количество койко-мест достигло 1537; клиника была оснащена высокотехнологичным оборудованием мировых производителей. Структура учреждения: клинический комплекс, перинатальный центр, лечебно-реабилитационный комплекс, детский лечебно-реабилитационного комплекс, научно-исследовательский нейрохирургический институт им. А. Л. Поленова. В 2017 г. Центр получил статус национального и переименован в федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный медицинский исследовательский центр имени В. А. Алмазова» Министерства здравоохранения Российской Федерации и сегодня является крупнейшим объектом здравоохранения в Северо-Западном федеральном округе. Имеет статус Сотрудничающего учреждения Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ).
В 2009 — 2010 г. при строительстве новых корпусов и реконструкции медицинского комплекса при устройстве внутренних стен: перегородок, облицовок в санитарных узлах, была использована комплектная система Влагостойкие решения КНАУФ с АКВАПАНЕЛЬ ® Внутренняя. Это конструкции облицовок, перегородок из однослойной или двуслойной обшивки плитами АКВАПАНЕЛЬ ® Внутренняя на металлическом каркасе, для использования в зонах с повышенной влажностью для отделки несущих конструкций и улучшения влагостойкости помещения. Выбор данной строительной технологии специалистами проекта обусловлен уникальными свойствами цементной плиты АКВАПАНЕЛЬ ® Внутренняя: абсолютная влагостойкость и устойчивость к образованию плесени, грибка; а также возможность быстрого монтажа.